91ÊÓÆ”

jerva26

Jeroen van der Laak

Gästprofessor

Min forskning handlar om att genom maskininlärning och stora mängder data förbättra cancerdiagnostik och prognosticering.

Deep Learning

Framsteg inom digitalisering av vävnadsprov och maskininlärning har drivit på forskningen om beräkningspatologi. Speciellt användningen av 'deep learning'-tekniker, där man tränar systemet med ett stort antal histo-patologiska bilder, har visat sig vara mycket kraftfullt.

Idag nÀrmar sig datorsystemen nivÄn hos mÀnniskor för vissa vÀldefinierade uppgifter i patologi. Ett exempel Àr rÀkningen av mitoser för gradering av bröstcancer och detektering av lymfkörtelmetastaser för att avgöra tumörstadium.


Min forskning fokuserar pÄ utveckling av sÄdana 'deep learning'-algoritmer.

Syftet Àr tvÄfaldigt:

  1. Att stödja patologernas arbete genom att öka effektiviteten och minska risken för pÄverkan av observatörens egna förutfattade meningar (observer bias).
  2. Att identifiera potentiella nya (prognostiska och prediktiva) biomarkörer för att ta fram en individuell behandling.


För att kunna nÄ dessa mÄl finns det fortfarande ett antal utmaningar kvar att lösa. En viktig förutsÀttning för utveckling av 'deep learning'-algoritmer Àr tillgÀngligheten av data (bÄde av hög kvalitet och i stor mÀngd). En stor del av forskningen Àr dÀrför inriktad pÄ att etablera samarbeten, förvÀrva kliniska data sÄvÀl som mÀnskliga vÀvnadsprover och arbeta med expertpatologer runt om i vÀrlden.

DÀrefter krÀvs forskning om olika 'deep learning'-strategier för att utveckla de mest optimala modellerna.

Slutligen mÄste utvecklade modeller valideras i rutinmÀssig klinisk praxis för att bevisa sÀkerhet och anvÀndbarhet.

Min forskning syftar till att fokusera pÄ alla dessa olika aspekter, med det slutliga mÄlet att förbÀttra cancerdiagnostik och prognoser.

Publikationer

2024

Joep M. A. Bogaerts, Miranda P. Steenbeek, John-Melle Bokhorst, Majke H. D. van Bommel, Luca Abete, Francesca Addante, Mariel Brinkhuis, Alicja Chrzan, Fleur Cordier, Mojgan Devouassoux-Shisheboran, Juan Fernandez-Perez, Anna Fischer, C. Blake Gilks, Angela Guerriero, Marta Jaconi, Tony G. Kleijn, Loes Kooreman, Spencer Martin, Jakob Milla, Nadine Narducci, Chara Ntala, Vinita Parkash, Christophe de Pauw, Joseph T. Rabban, Lucia Rijstenberg, Robert Rottscholl, Annette Staebler, Koen van de Vijver, Gian Franco Zannoni, Monica van Zanten, Joanne A. de Hullu, Michiel Simons, Jeroen van der Laak (2024) The journal of pathology. Clinical research, Vol. 10, Artikel e70006 (Artikel i tidskrift)
Khrystyna Faryna, Leslie Tessier, Juan Retamero, Saikiran Bonthu, Pranab Samanta, Nitin Singhal, Solene-Florence Kammerer-Jacquet, Camelia Radulescu, Vittorio Agosti, Alexandre Collin, Xavier Farre, Jacqueline Fontugne, Rainer Grobholz, Agnes Marije Hoogland, Katia Ramos Moreira Leite, Murat Oktay, Antonio Polonia, Paromita Roy, Paulo Guilherme, Theodorus H. van der Kwast, Jolique van Ipenburg, Jeroen van der Laak, Geert Litjens (2024) Modern Pathology, Vol. 37, Artikel 100563 (Artikel i tidskrift)
Khrystyna Faryna, Jeroen van der Laak, Geert Litjens (2024) DIGITAL AND COMPUTATIONAL PATHOLOGY, MEDICAL IMAGING 2024, Artikel 1293304 (Konferensbidrag)
Roberto A. Leon-Ferre, Jodi M. Carter, David Zahrieh, Jason P. Sinnwell, Roberto Salgado, Vera J. Suman, David W. Hillman, Judy C. Boughey, Krishna R. Kalari, Fergus J. Couch, James N. Ingle, Maschenka Balkenhol, Francesco Ciompi, Jeroen van der Laak, Matthew P. Goetz (2024) npj Breast Cancer, Vol. 10, Artikel 25 (Artikel i tidskrift)
Yiping Jiao, Jeroen van der Laak, Shadi Albarqouni, Zhang Li, Tao Tan, Abhir Bhalerao, Shenghua Cheng, Jiabo Ma, Johnathan Pocock, Josien P. W. Pluim, Navid Alemi Koohbanani, Raja Muhammad Saad Bashir, Shan E. Ahmed Raza, Sibo Liu, Simon Graham, Suzanne Wetstein, Syed Ali Khurram, Xiuli Liu, Nasir Rajpoot, Mitko Veta, Francesco Ciompi (2024) IEEE journal of biomedical and health informatics, Vol. 28, s. 1161-1172 (Artikel i tidskrift)

Nyheter

Forskning

Organisation