91ÊÓÆ”

sofny42

Sofie Nyström

Universitetslektor, Docent

Prioner och proteinbeläggningar

Presentation

Mitt forskningsintresse kretsar kring amyloidproteiner, deras strukturella heterogenitet och hur dessa entiteter är kopplade till sjukdom. Vi använder provrörs- och bioanalyser för att hjälpa oss förstå hur proteiner av både mänskliga proteiner och proteiner från virus bildar amyloid, hur amyloider och proteiner från olika ursprung interagerar och hur dessa interaktioner dikteras av amyloidstrukturen.

Amyloider

Proteiner Àr cellens arbetshÀstar och Àr avgörande för de kemiska processer och transporter som pÄgÄr i alla levande organismer. För att kunna utföra sin funktion mÄste proteinet vara aktivt genom att anta sin funktionella struktur. De flesta proteiner fÄr en unik tredimensionell veckning, men vissa Àr naturligt oordnade. Ibland förlorar dock proteiner sin naturliga struktur och bildar en felveckad form. Detta kan vara skadligt för vÀrdcellen, vÀrdorganet och i slutÀndan hela organismen.

En undergrupp av felveckade proteiner kallas amyloider. Amyloider bildar avlagringar av vÀlstrukturerade buntar av felveckade proteiner. De kan hittas i vilket organ som helst i kroppen, och mer Àn 40 proteiner har kopplats till amyloidsjukdomar hos mÀnniskor.

Virusamyloider

Mitt intresse för virusproteiner, och i synnerhet virusprotein-amyloider, vÀcktes under SARS-CoV-2-pandemin. Jag slogs av likheterna mellan symtomen vid svÄr och lÄngvarig Covid och flera amyloidassocierade sjukdomar.

Proteiner hos dÀggdjur har utvecklats för att förhindra amyloidbildning och dÀrigenom hÄlla oss friska under vÄr lÄnga livslÀngd. Virus, Ä andra sidan, gynnas inte av en proteom med lÄg benÀgenhet att bilda amyloid. Faktum Àr att mÄnga virusproteiner frÄn olika virusfamiljer bildar amyloider.

I vÄr forskargrupp anvÀnder vi proteinvetenskapliga verktyg samt in vivo-modeller för att undersöka hur virusderiverade proteinsekvenser bildar amyloider in vitro. Vi kartlÀgger ocksÄ hur virusamyloider pÄverkar mÀnskliga proteiner.

Forskargruppens medlemmar i virusamyloidprojekt:
Postdoktor: Debdeep Chaterjee
Masterstudenter: Vilma Odland, Henrik Westman, Ebba Hellstrand

Polymorfism hos amyloider och prioner

Min forskning om amyloidstrukturer fokuserar pĂ„ att kartlĂ€gga skillnader i amyloidstruktur – amyloidpolymorfism – genom en kombination av rekombinant uttryckta proteiner, djurmodeller av sjukdomar, biofysikaliska tekniker och nya fluorescerande prober. Det Ă€r av största vikt att förstĂ„ skillnaderna mellan dessa strukturer.

Prionstammar och deras egenskaper Àr goda exempel pÄ hur strukturell polymorfism pÄverkar sjukdomsförloppet. En molekylÀr förstÄelse av amyloidstrukturer, vad som styr deras bildning och omvandling, samt vilka amyloidformer som Àr mest skadliga för vÀrden, kommer att underlÀtta utvecklingen av nya diagnostiska verktyg och mer precisa behandlingsmetoder.

Prioner

Prionforskningen bedrivs i vÄrt P3**-laboratorium, som ligger vÀgg i vÀgg med vÄr vanliga laboratoriemiljö.

Vissa amyloider har smittsamma egenskaper pÄ grund av sin sjÀlvförökande förmÄga. Bland de smittsamma amyloiderna Àr prioner de mest kÀnda. HÀr omvandlas det naturliga PrP-proteinet till nya amyloider genom interaktion med infektiösa prioner. Prioner blev ökÀnda under galna ko-sjukan (BSE) pÄ 1980-talet och de fall av Creutzfeldt-Jakobs sjukdom hos mÀnniskor som följde i dess spÄr.

Vi anvÀnder rekombinant humant prionprotein (PrP) samt prionproteiner frÄn andra dÀggdjursarter för att kartlÀgga de molekylÀra mekanismerna bakom felveckningen av detta gÄtfulla protein. Vi anvÀnder ocksÄ PrP som substratprotein för att undersöka möjliga korskontamineringsmekanismer som kan vara involverade i initieringen av prionsjukdomar.

Nyheter

Publikationer

2025

Farjana Parvin, Johan Larsson, Walker Jackson, Sofie Nyström, Per Hammarström (2025) Journal of Molecular Biology, Vol. 437, Artikel 168923 (Artikel i tidskrift)
Gunilla T. Westermark, Ebba Nystrom, Sofie Nyström, Peter Nilsson, Per Hammarström, Per Westermark (2025) Scientific Reports, Vol. 15, Artikel 3684 (Artikel i tidskrift)
Therése Klingstedt, Hamid Shirani, Farjana Parvin, Sofie Nyström, Per Hammarström, Caroline Graff, Martin Ingelsson, Ruben Vidal, Bernardino Ghetti, Dag Sehlin, Stina Syvanen, Peter Nilsson (2025) Journal of Biological Chemistry, Vol. 301, Artikel 108032 (Artikel i tidskrift)

2024

Marikken Sundnes, Priyanka Swaminathan, Mikael Lindgren, Ganesh Mohite, Ebba Hellstrand, Sofie Nyström, Per Hammarström (2024) ChemPhotoChem (Artikel i tidskrift)
Lovisa Johansson, Alexander Sandberg, Sofie Nyström, Per Hammarström, Martin Hallbeck (2024) Journal of Neurochemistry, Vol. 168, s. 3308-3322 (Artikel i tidskrift)